水晶的分類是五花八門，通常可以大致分為三類：

①CrystallineVarieties（顯晶類）

平時我們觀賞到由多條六角形水晶柱（六方晶系）生成一簇的水晶簇，便是屬于CrystallineVarieties顯晶類，如白水晶、紫水晶、黃水晶、粉晶、發晶、虎眼石等皆屬此類。

②CryptocrystallineVarieties（隱晶類）

隱晶類水晶外觀是一塊塊的，不是成六角水晶簇狀，但他們卻也是屬六方晶系的。但我們不能以肉眼觀察到他們的六角形結晶，因為結晶的體積極為細小，需以顯微鏡協助下才能看到六角開結晶。而此在水晶非常平滑，因為結晶之間有“水化硅石”填補，瑪瑙便屬于此類。

③SpecialVarieties（特別類）

這類水晶和一般水晶分別很大，難以歸為顯晶類或隱晶類，所以歸為特別類，例如結晶古怪嶙峋的SkeetonCrystal（骨干水晶）、水晶內的山水星像圖案的PhantomCrystal（幻影水晶）等皆歸納為此類。

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