科學家們曾把水晶頭骨和真正的人類頭骨作了比較，發現除了眼部特征稍稍偏于人類的正常范圍以外，其他參數都與真正的人類頭骨相差無己.我們知道，近代光學產生于十七世紀，而人類準確地認識自己的骨骼結構更是十八世紀解剖學興起以后的事。這個水晶頭顱卻是在非常了解人體骨骼構造和光學原理的基礎上雕刻成的，一千多年前的瑪雅人是怎樣掌握這些高深的解剖學和光學知識的呢？

據說水晶頭骨有催眠功能，如果讓一個緊盯著水晶頭骨的眼睛處，不多時人便會感覺昏昏欲睡，傳說頭骨是瑪雅人為病人做手術時催眠病人用的。

另外，水晶是世界上硬度最高的材料之一，用銅、鐵或石制工具都無法加工它，而1000多年前的瑪雅人又是使用的什么工具呢？另外，這種純凈透明的水晶雖然硬度很高，但質地卻脆而易碎，科學家們推斷：要想在數千年前把它制作出來的話，只可能是用極細的沙子和水慢慢地從一塊大水晶石上打磨下來，而且制作者要一天24小時不停地打磨300年，才能完成這樣一件曠世杰作.

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