珊瑚玉的顏色大致可分為兩大類，一是原生色，二是次生色。原生色包括玉的本色，玉中雜質的顏色，玉與圍巖相接之處玉與石交融的顏色，以及玉在成礦過程中再次交融、再次變質改變的顏色。

次生色還可分為天然次生色和人為次生色。天然次生色是珊瑚玉形成之后，在漫長的地質年代，特別是褶皺上升到山上或初露地表之后，玉與周圍的巖石、土壤、植物發生接觸，通過滲透、浸泡、晾曬、靠染等作用，一些礦物成分進入玉中，玉中的一些礦物成分也會發生變化，這些都能改變玉石的原來顏色。

人為次生色是指珊瑚玉進入了人們的生活后，受到人為因素的影響，例如長期佩戴、盤玩擦抹，玉件會在表皮和內部慢慢出現轉色。這是人們的汗脂、生活物品的接觸、空氣的氧化、光照等因素的影響造成的。亦或是人為在珊瑚玉器的某個部位加工做上顏色，這種顏色的改變是人類活動造就的，所以也叫做人為次生色。

但一定要注意，染色的珊瑚玉玉則連“次生”都算不上，是人為“上色”，完屬于造假，這種珊瑚玉基本沒什么價值，也不值得一玩。

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