對于任何種類的寶石來說，凈度指標直接關系到其美觀程度和價值高低，彩色寶石也不例外。因此，消費者在選購時應著重考慮其凈度指標。

據北京世紀金源珠寶城品·珠寶店創始人張軍介紹，對寶石凈度的評鑒，應主要從表面是否有瑕疵和內部是否有雜質兩方面入手。其中，表面瑕疵包括切割師在打磨過程中留下的印記或因長期佩帶而留下的摩擦痕跡。這些瑕疵屬于表面印記，將寶石再次拋光打磨即可消除，并不影響對其凈度的評鑒。內部雜質則是影響寶石凈度指標的主要因素，包括洞痕、缺口、云狀物、羽裂紋、手指紋、內含晶體、針狀物、針點等。張軍表示，寶石的內含物越多、越明顯，其價值就越低。

據張軍介紹，在彩色寶石業界，通常把寶石的凈度分為一類、二類、三類共三個等級。

其中，一類凈度的寶石用肉眼看不到雜質，代表品種有：綠柱石（綠色、黃色、粉色）、海藍寶石、綠碧璽、藍色鋯石、金綠寶石（綠色、黃色）、坦桑石、水晶（茶水晶、黃水晶）、鋰輝石（粉色、綠色）、托帕石（藍色、黃色、橙色、粉紅、紅色），這些寶石頗受高端珠寶商的青睞；二類凈度的寶石會有內含物且肉眼能夠觀察到，代表品種有：紅寶石、藍寶石、彩色藍寶石、碧璽（藍色、橙色、紫色、黃色、雙色但不包括西瓜碧璽）、亞歷山大變石、鋯石（綠色、橙色、黃色、紅色）、紫水晶、尖晶石（所有顏色）、橄欖石、堇青石；三類凈度寶石的內含物較多且十分明顯，代表品種有：祖母綠、碧璽（紅色、粉色、西瓜碧璽）。

值得一提的是，盡管祖母綠寶石的凈度沒有那么高，但其卻憑借著艷麗的翠綠色躋身頂級寶石行列，價格甚至超出其他種類凈度好的寶石。

張軍強調，每顆寶石內含物的性質、大小、數量、位置、顏色都不同，因此不能僅通過單純的種類來確定等級。例如一顆寶石的內含物明顯且位于中間部位，那么其價值就很低，因為這種瑕疵不便通過鑲嵌等手段來掩蓋。

。