瑪瑙和水晶的化學成分都是二氧化硅，但二者還是有一些區別，水晶是單晶體，一塊水晶通常是一個水晶晶體，而瑪瑙則是多晶集合體，在電子顯微鏡下看到瑪瑙則是由無數微小的二氧化硅的晶體組成，所以通常瑪瑙是半透明的，而水晶則是透明的。

人們對瑪瑙質量和經濟價值的評判，一般都是以肉眼識別作為主要手段，瑪瑙質量好壞的鑒別和經濟價值的評定主要分級如下：

1、特級：紋帶美麗；顏色純正、明快的紅、藍、紫、粉紅色；透明度好，即半透明；無裂紋、無砂心、無雜質；塊重約5公斤以上者。

2、一級：紋帶美麗；顏色純正、明快的紅、藍、紫、粉紅色；透明度好，即半透明；無裂紋、無砂心、無雜質；塊重約2－5公斤者。

3、二級：紋帶美麗；顏色純正、明快的紅、藍、紫、粉紅色；透明度好，即半透明；無裂紋、無砂心、無雜質；塊重約0.5－2公斤者。

4、三級：紋帶美麗；顏色純正、明快的紅、藍、紫、粉紅色；透明度好，即半透明；無裂紋、無砂心、無雜質；塊重約0.5公斤以下者。

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