水晶的生長環境多是在地底下、巖洞中，需要有豐富的地下水來源，地下水又多含有飽和的二氧化硅，同時此中的壓力約需在大氣壓力下的二倍至三倍左右，溫度則需在550-600℃間，再給予適當時間，水晶就會依著六方晶系的自然法則，而結晶成六方柱狀的水晶了。

在人為控制的理想環境當中，即是物理、化學條件都符合上述條件的狀況下，水晶的生長速度約是每天0.8公厘(MM)。這也是許多人造水晶的實驗室、工廠的標準生產速度。由此所培養出來的水晶，就是所謂的“人造水晶”，通常多切割為芯片供作電子、計算機、通訊工業用途;也有人稱為“養晶”，雖是使用不同的名詞，其實講的是相同的東西。一般，工業用途的人造水晶，其厚度約需三公分左右，即30MM，需要約40天左右的時間來成長;若要供作珠寶業來磨成十公分(100MM)以上的水晶球，通常約需120-180天也就夠了。但是，這都是在人為控制下最理想的環境中，才有可能有這種速度，在自然界中，情形就沒有這幺樂觀，因為原料、水質、溫度、壓力等等的條件一直在變化當中，很難得達到理想狀況，通常都需要數萬倍、或是數百萬倍的時間，才能達到相同的成長。這也是為什么“地質年齡”動輒以“百萬年”為計算基數，也是“天然水晶”之所以珍貴之處。

由于在地底、巖洞中的生長空間多狹窄，尤其在遇到地震時，或地殼變動時，甚至容易遭到其它礦石的擠壓，常常會壓迫產生不同的“晶面”。當水晶還是液態狀時，常常也會包覆其它礦石、泥灰一起結晶成長，如金紅石(稍后變成發晶)、火山泥灰(稍后變成幻影水晶)等等。所有這些都是自然結晶的一部份，不應視為瑕疵。

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