南紅瑪瑙的紅有深有淺，因為是天然的礦石，所以它純色的不多，很多還是混色的，所以有很多的像是紅橙色、紅褐色等，還有更多不同的深淺，有深紅、淺紅、暗紅等等。上乘的南紅瑪瑙總是給人一種材質溫潤如脂，顏色都紅的濃艷的印象。南紅瑪瑙的顏色是評價南紅瑪瑙價值的一個重要的標準。

南紅瑪瑙區別于一般紅瑪瑙的地方就是他的顏色。許許多多細密的朱砂點組合在一起形成了我們最后看到的紅。南紅瑪瑙中的朱砂點越多越細，南紅的色澤就越紅潤。南紅瑪瑙中最昂貴的顏色就是錦紅，這種顏色也是大家都比較認可的有收藏價值的南紅。

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